1965 metais Kauno miesto liaudies švietimo skyriaus vedėjo 1965 m. birželio 8 d. įsakymu Nr. 23, Gričiupio mikrorajone duris atvėrė lopšelis-darželis Nr. 66, kuriam 1994 m. vasario 9 d. Kauno miesto mero nutarimu Nr. 119 buvo suteiktas „Malūnėlio” vardas.
Įstaigoje veikia 11 grupių: 4 ankstyvojo ugdymo, 5 ikimokyklinės ir 2 priešmokyklinės. Atsižvelgiant į visuomenės poreikį, nuo 2024 m. rugsėjo 1 dienos įstaigoje įsteigta kūdikių grupė (4 val. per dieną) vaikams iki 1-ių metų amžiaus, kurioje ne tik užtikrinama kvalifikuota priežiūra, bet ir teikiamas kokybiškas ankstyvasis ugdymas.
Įstaigoje ikimokyklinis vaikų ugdymas organizuojamas vadovaujantis įstaigos pedagogų parengta individualia Ikimokyklinio ugdymo programa, o priešmokyklinis ugdymas vykdomas remiantis Priešmokyklinio ugdymo bendrąja programa. Siekiant atliepti sveikatą stiprinančios mokyklos statusą, įstaigoje įgyvendinama pedagogų komandos parengta sveikatos stiprinimo programa „Sveikatos karuselė“. Programa siekiama gilinti žinias bei formuoti sveikos gyvensenos įgūdžius. Didelis dėmesys skiriamas vaikų emocinės sveikatos ugdymui. Visose grupėse įgyvendinamos socialinio emocinio ugdymo programos „Kimochi“, „Dramblys“ arba „Zipio daugai”.
Lopšelyje-darželyje dirba kvalifikuota, pasirengusi atliepti visus vaikų poreikius, ikimokyklinio, priešmokyklinio ir meninio ugdymo mokytojų komanda. Švietimo pagalbą teikia profesionalūs švietimo pagalbos specialistai – psichologas, socialinis pedagogas bei logopedas. Vaikams, turintiems didelių (ar labai didelių) specialiųjų ugdymosi poreikių, pagalbą teikia mokinio padėjėjai.